مخزن حاضر، ثمره بیش از دو دهه گردآوری، بازخوانی و پالایش دیجیتال از نسخ خطی بازمانده از تمدن‌های کهن شرق، بیزانس، حوزه‌های علمیه اندلس، ایران، بین‌النهرین و هند باستان است. دانش‌های مکتوم که در سنت فکری قدما ذیل عنوان «علوم غریبه» یا «علوم خفیه» طبقه‌بندی می‌شدند، منظومه‌ای ترکیبی از نجوم احکامی، ریاضیات سرّی، هندسه مقدسه، علم حروف، طلسمات و کیمیای عملی را تشکیل می‌دادند. این آثار در واقع تلاش متفکران قرون گذشته برای کشف پیوندهای پنهان میان عالم علوی (کواکب و افلاک) و عالم سفلی (طبیعت، فلزات و روان آدمی) به شمار می‌رفتند.
پنج علم خفیه بنیادین: راز واژه «کُلَّهُ سِرّ»
در سنت مکتوب علامه مجلسی، فخر رازی و ابوالقاسم کاشانی، علوم سرّی به پنج شاخه محوری تقسیم می‌شدند که از تلفیق حروف اول آن‌ها کلمه «کُلَّهُ سِرّ» (همه آن راز است) پدید آمده است:
تبدیل قوای عناصر، اکسیر اعظم و پیوند با طب سنتی کهن جابر بن حیان.
علم تسخیرات، پیوند ارواح کواکب و رموز ساخت طلسمات نجومی موقت.
تسخیر طبایع جوی و فلکی و ایجاد پیوندهای تسخیری در ارواح خاکی.
دانش ترکیب قوای ارادی با حروف، اعداد و اوفاق برای رویت خوارق عادات.
شعبده عقلی و فیزیکی، انکسار انوار و شگفتی‌های مکانیک کهن و حیل نادره.
شاهکارهای نسخه‌شناسی و نگارش‌های کلاسیک در آرشیو
از برجسته‌ترین گنجینه‌های ثبت‌شده در این مخزن، می‌توان به تصحیح چندگانه رساله «شمس المعارف الکبری» تالیف ابوالعباس البونی (متوفی ۶۲۲ ق) با بیش از چهل جدول اوفاق نجومی منحصر‌به‌فرد، رساله «تحفه الاغراب» سکاکی در تشریح قواعد علم جفر جامع، و کتاب نایاب «اسرار قاسمی» ملاحسین واعظ کاشفی اشاره کرد. تمامی نسخه‌ها با نسخه مقابله‌ای کتابخانه‌های مرجع بغداد، استانبول و آستان قدس تطبیق خط به خط یافته‌اند.
- ارزش اسنادی و زبان‌شناختی: بررسی تحول خطوط تعلیق، نستعلیق جلی و نسخ مغربی و خطوط معمی در اسناد از سده پنجم تا دوازدهم هجری.
- وضوح نگاره‌ها و تذهیب‌ها: اسکن فوق دقیق عطف‌ها، سرلوح‌ها، جداول شطرنجی و ارقام خط جفر کبیر با حفظ کوچک‌ترین نقاط و اعراب کهن.
- تطبیق فقهی و مردم‌شناختی: راهنمای محققین برای درک باورهای عامه، نجوم احکامی دوره صفوی و طب سنتی مزاج‌شناسی تطبیقی.
ارائه این متون صرفاً با هدف نگهداری میراث مکتوب تمدنی، تحقیقات آکادمیک در تاریخ علم و شناخت سیر تحول نمادها و فلسفه شرق صورت می‌پذیرد. آرشیو دیجیتال هیچ‌گونه دخل و تصرفی در متن تاریخی و اوفاق نگاشته‌شده توسط کاتبان سده‌های پیشین اعمال ننموده است.